在他和一批语言学专家学者的共同努力下，1980年，新疆大学人文学院语言硕士学位授予权获得国务院批准，这是我国少数民族地区首家拥有语言学硕士学位授予权的高校。时至今日，这个硕士学位授予点已经培养出50多名现代语言学的研究生。
新疆大学语言学1996年有了博士学位授予权，2003年成为国家级重点学科，2004年成立了博士后科研流动站。新疆大学少数民族语言文学成为国家级一类特色专业。
长期在新疆做语言学研究教学，让徐思益很早就开始关注并研究新疆语言的发展变化，先后撰写了多篇与新疆少数民族语言有关的语言学文章，深入探讨了现代语言学在民族地区的实际应用。他撰写的文章《认真执行民族语言政策》《古代汉语在西域》《论语言的民族变体》和《推进新疆民族语言大发展》等，对新疆推行国家通用语言文学的工作起到了很大的作用。
高莉琴回忆起这样一件事：上世纪90年代，徐思益组织了新疆一批不同学校、不同民族，不同专业的中青年骨干教师，申请并承担了国家“八五”社科课题“语言的接触和影响”项目。这是新疆大学第一次申请到国家社科课题，虽说课题经费很少，但大家还是十分认真努力，深入到南北疆农村牧区进行调研。
“徐思益教授手把手地教我们，在乡村调研时，我们用最原始的录音机，录下需要调查的语言，回到学校反复地听，反复地记录，直到把语言表达的内容听明白，完整地记录下来后才罢休。想想那个课题，真是很苦，但徐思益教授一点也没有说苦，年纪很大了，整天乐呵呵地和我们一起跑东跑西。”高莉琴说。
这个课题项目完成后，1997年出版了论文集《语言的接触和影响》。全书共12个专题，调查研究了维吾尔族、哈萨克族使用汉语的情况。最主要的是，第一次提出了维吾尔族、哈萨克族使用汉语时，在语音、词汇、语法等方面都呈现出的母语印迹，使汉语产生了系统性变异。
