“我以前皮肤是很白的,“邓云笑着说道,”但是在地里做育种工作这么多年,很难不晒黑,我们团队其他育种家都和我肤色差不多。“
接受采访前,邓云刚走出北大农研院的育种大棚。
也正是对每份西瓜材料都了如指掌,才能使他们在后期投稿,面对审稿人质疑“材料不对“时,第一时间不是自我怀疑,而是摆出证据。
他们花费近一个月的时间,仔细查找材料信息和审稿人的相关文章,并与种质资源库负责人进一步核实后,委婉回复了对方。
“作为一个研究了西瓜四十多年的人,张兴平老师可以说是全世界对西瓜最了解的人。”邓云笑着说,“我们对材料是非常自信。”
邓云(左)和张兴平(右)在调查植株生长情况
邓云(左)和张兴平(右)在调查瓜
张兴平在调查西瓜,发现好的组合
握紧接力棒向构建西瓜属超级泛基因组图谱冲刺
构建T2T水平超级泛基因组的过程,如同一场三棒接力赛。第一棒是深入田间地头,种植材料,不断取样,第二棒送样测序,第三棒则是数据分析。
田间湿透衣服的第一棒完成后,就到了测序阶段。
应用最先进的HiFi、HiC和、ONT等三代测序技术,虽然完成了基因组的初组装,但是仍然难以做到全部实现T2T和无缺口的组装。
2021年底,随着李博生加入团队,利用自己研发的选择性测序方法和超长测序技术填补了基因组的存在和端粒,全部基因组均实现了T2T和无缺口的组装。
继李博生完成测序工作后,何航带领团队夜以继日完成最后冲刺,常常做数据分析做到半夜两三点。
每两周开一次组会,讨论进展、分析结果、分享新的发现,是接力赛顺利完成交接棒的原因。
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