和美国农业部专家进行视频沟通
和国外测序公司视频会议
比西瓜还要了解西瓜
西瓜要一口一口吃,目标也要一步步实现。
泛基因组是一个物种中所有个体基因组信息的总和,构建泛基因组可以有效解决单一参考基因组带来的信息缺失和分析偏差。而超级泛基因组则代表一个属内所有物种的基因组信息,尤其蕴含了野生种中丰富的基因组变异,是对泛基因组的进一步扩展,在远缘杂交和基因发掘等方向具有重要应用前景。
想要将野生西瓜中的抗病耐逆优良基因导入到栽培西瓜,最好先得到野生西瓜的参考基因组,然后再构建包含所有野生种的西瓜属超级泛基因组。
收集西瓜属全部7个种的代表性材料成为团队首要解决的问题。
项目启动时团队已收集了五个种的材料,并从中国农
科院
国家种质资源研究库引进第六个种。而最后一个种也就是诺典西瓜的获取,困扰团队许久。
从国外引进种质资源程序复杂、审核严格,团队历经千难险阻终于拿到了诺典西瓜的种子,然而播种后一个月、两个月都没有一点发芽迹象。团队想尽办法,用赤霉素处理、组培等等方法都进行了尝试,最终均以失败告终。
“后来,张兴平老师得知美国农业部种质资源中心有我们所需要这份材料,而且有植株,我们立刻联系相关负责人以及美国测序公司,由美国农业部种质资源中心的合作伙伴取样后送到测序公司,公司进行测序后再将结果反馈给国内。“邓云回忆。
回顾如何解决,邓云解释轻松,两三句话就将耗时一整年多的过程概括完成。
在他们看来,这只是实现目标的必经历程,没有难易点之分,只要完成即可。被晒得黝黑的皮肤,在大棚里湿透的衣服,都只是过程。
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