阿苏火山位于熊本县东北部，是日本最活跃火山之一，也是游客徒步旅行的圣地。它由5座火山组成，最高的海拔1592米。现阶段，日本气象厅仍把阿苏火山的警戒级别维持在2级。只是，气象厅官员没有把火山喷发与地震直接关联。
另外，地震发生后，日本气象厅一度发布海啸预警，称九州岛西部海域可能出现高达1米的海啸，但这一警报不久后解除。
交通运输方面，大量公路受到不同程度损坏；熊本县机场一处天花板在地震中坠落，机场暂时关闭，尚不清楚航班何时恢复。
鉴于天气情况恶劣，日本政府提醒灾区民众在保持镇静的同时提高警觉，尤其注意可能发生的山体滑坡和泥石流。政府还要求灾区内一座水坝附近的民众撤离，以防水坝坍塌，带来次生灾害。
日本首相安倍晋三原定16日前往九州岛视察救灾工作，但这一行程随后被取消，改为在首都东京召开应灾会议。官方没有解释安倍为什么取消此次行程。
日本原子力规制委员会说，16日的地震发生后，九州岛境内核电站未见异常。出于安全考量，原定16日在灾区及周边地区举行的一些体育赛事全部取消。更多大型企业将继续停工。
