“我们不只有一个基因组，微生物群系基本上就是我们的第二个基因组，它们增强了我们自己的活力，”美国加州理工学院的微生物学家Sarkis Mazmanian教授说，“在我看来，是什么让我们成为了人类，就是我们自己的DNA和我们肠道内微生物DNA的结合。”
千万不要天真地认为如此多的微生物物质不会与我们发生相互作用，或者以为它们不会对我们的身体产生影响。科学正在迅速揭示微生物群系在消化系统中发挥的重要作用，它们还对免疫系统调节、疾病防御和重要维生素的生成有重要影响。
奈特教授表示，科学家正在探索这些微小生物如何以我们直到最近才能想象的方式彻底改变我们的健康。这是一种思考微生物世界的新方式。迄今为止，我们大多数时候与微生物之间的关系都是在不断地斗争。
微生物生命最集中的地方是在人体的肠道。在缺氧的肠道环境中，微生物生态系统十分复杂，菌群生物量也极为庞大。
微生物战场
抗生素和疫苗一直都是对抗天花、结核杆菌或耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的武器。它们都是好东西，从诞生至今已经拯救了无数人的生命。不过，一些研究者担心，我们对“坏家伙”的攻击已经对那些“好细菌”造成了无法估量的损害。
“过去50年来，我们在消除传染病方面做得非常出色，”鲁斯·莱教授说，“但我们已经看到自身免疫疾病和过敏症出现了惊人而可怕的增加。”在对抗病原体获得成功的同时，我们看到了微生物群系的改变，而这反过来又导致了一系列我们不得不面对的疾病。
