然而，刨除并不具备全年业绩参考性的单季度数据，捷安高科近年来的盈利表现仍难言优秀。对于A股上市来说偏小的体量下，还存在毛利率波动、应收账款增加，与税收优惠政策到期等重重隐忧。
捷安高科综合毛利率在2015年同比上浮11.6%，达到59.44%的高位后，又在经历连续两个报告期的下滑后，回到了53.96%的水平。根据招股说明书的解释，公司产品具有定制化的特点,公司为每个订单设计和生产的软硬件结合产品均具有自身的独特性,销售定价和成本构成具有一定差异,因此毛利率将不可避免地出现波动。另外,公司主要通过招投标方式取得合同,报价不仅受合同执行成本的影响,同时还受到招投标竞争激烈程度的影响，这也是影响毛利率的一大不可控因素。
与毛利率波动下降形成鲜明对比的，是公司应收帐款的显著增加。2014 年末尚只有1193.57万元的应收款，在经历了2015 年末至1364.16万元的小幅上涨后，到2016年末极速增长为5623.66万元,占同期公司营业收入的比例也随之膨胀到了35.22%。
经济观察报记者还发现，捷安高科1年以内应收账款2%、1-2年内5%，及2-3年内20%的坏账计提比例均远低于同行业上市或挂牌公司分别对应的5%、10%、30%的普遍情况。
此外，软件信息服务行业身份所赋予公司的税收政策倾斜，在财务报表上表现得尤为突出。2014-2016年，公司的税收优惠金额合计达609.48万元、711.78万元、1136.29万元，占当期利润总额的比例则分别达到38.27%、30.6%及32.77%。
然而，经济观察报记者在查阅招股说明书后发现，捷安高科于2014年10月被河南省政府评定的高新技术企业资质，只能保证公司在2014-2016年间享受企业所得税减按15%税率计缴的优惠。此外，捷安高科的全资子公司北京申谋也将在2018年面临高新技术企业有效期到期的情况。如果公司未能通过国家主管部门的重新认定，则会直接影响公司的利润水平。
截至招股书签署日，捷安高科有5 家全资子公司和1家控股子公司，北京申谋、北京嘉普、郑州军工、郑州通晓、捷安销售和郑州捷硕。除2017年4月成立的捷安销售尚未开展经营之外，其余五家子公司2017年1-3月净利润均为亏损。
