事业就像接力赛，需要一棒接一棒地传递。余元君深知治理洞庭湖非一朝一夕之功、一人一生之劳可至，因此非常注重培养青年，壮大“洞庭人”队伍。他倡导同事们将时间分为四份：一份处理日常工作，一份进行巡查调研，一份用来钻研业务，一份全面了解洞庭湖。他勉励青年同志勤奋学习、刻苦钻研，早日成为治湖的行家里手。他热忱地与大家分享自己的研究成果，其自主完成的《洞庭湖项目法人工程建设管理文件汇编》，成为洞工局人手一本的“洞庭宝典”，有效推动了洞工局项目法人责任制改革顺利落实和治湖大工程高标准推进。他办公室和家里治湖资料如山，电脑硬盘里的电子资料也多达上千G。这些资料不仅是他的“个人财富”，也是与同事们分享的“公共财产”。与余元君共事20多年的洞工局一位副局长说：“余元君平时说话不多，但面对年轻人的请教，他总是不厌其烦，耐心讲解，直到他们把问题一个一个全部搞清楚。”2010年12月24日，在沅江市泗湖山镇出差的余元君，为帮助治湖施工单位的一位同志熟悉业务，在当地找了一个网吧，通过qq给对方远程辅导大半夜。这位年轻人感慨万分：“从此我就确信，守护平安的不是什么圣诞老人，而是像余总这样的‘洞庭人’。”

为帮助青年同志成长，余元君参与制作了六集专题片《八百里洞庭》，生动讲述洞庭湖作为湖南的母亲湖、长江的调蓄湖、全国的生态湖独有的水域经济和社会地位，引导年轻的“洞庭人”熟悉历史、了解现状。2017年9月，他担任湖南河道修防工职业技能培训总负责人，不但经常在野外亲自操作、给年轻人作示范，还选拔人才、组织队伍参加全国河道修防工竞赛，参赛的3位选手全部进入全国前15名，得到水利部充分肯定。

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