２０２５年底到达水星轨道后，两个探测设备将进入各自轨道，开始协作进行暂定为期一年的数据收集活动。
水星周边强大的太阳风容易影响水星磁场的测定，因此上述两个探测器在两个地点协同观测将可更加精确地测定水星磁场。这两个探测器将首次多角度综合观测水星的磁场、磁气圈、内部和表层，与地球进行比较，弄清行星磁气圈的普遍性和特异性。
日本宇宙航空研究开发机构介绍说，“水星磁层轨道飞行器”搭载有磁力计、等离子体及粒子观测装置等，主要目的是高精度测量水星周边磁场，探索水星磁场的成因，观测水星磁气圈的构造和运动。
而“水星行星轨道飞行器”搭载有激光高度计、加速度计、磁力计等多种观测设备，将主要观测水星重力场、表面地形、矿物、大气成分以及磁场等。
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