面对批评声浪，台湾相关检调部门召集内部会议，检视行动过程中有无瑕疵。根据媒体报道，结论是“搜索约谈并无法律问题，但执行技巧与应变能力不够，导致当事人透过直播将案件渲染成政治事件，需要改善”。
对此，台湾时政评论员黄智贤嘲讽：“这意思是，如果王炳忠乖乖就范，没有立刻开直播，社会就不会被那样违法凶残的画面震慑。”
《中国时报》２０日载文批评检调手段草率粗暴，抵触普通法律常识。文章说，如果司法人员心存成见预设立场，或自甘沦为政治操弄的工具，台湾怎么可能会有一个健全的司法体系，怎么可能赢得人民的信任？
《中国时报》的新闻分析说，民进党基于政治目的及对失去权力的恐惧，逐步透过法治手段建构独裁与集权执政模式，将多数心力放在整饬政敌、操控人民上，其结果除将徒增人民与执政者、政党与政党间的仇恨与对立，对巩固权力恐将适得其反。
《联合报》社论指出，当局这场行动恰如一面镜子，映照出民进党“新威权”的面目。“在野的时候，深知权力滥用之可怕；一旦执政，却充分享受滥权的美味，这正是民进党的权力观。但是，人民并不健忘，也未失智；白色恐怖就算漆成绿色，人们仍然认得它的模样。”
台湾淡江大学整合战略与科技中心研究员、助理教授罗庆生投书《旺报》指出，王炳忠等人前往大陆参访返台不久，即遭大阵仗调查，难免有刻意制造寒蝉效应的嫌疑。一年多来，包括台大出借场地给“中国新歌声”节目引发冲突、民进党立委提案修改“刑法”的“内乱外患罪”，都有将大陆视为“坏人”甚至“敌人”的倾向，“王炳忠案其实具有高度政治性”。
