给人才更具挑战性的环境
2004年姚期智回国后，建立了一支研究团队。但团队建立后，他发现团队里新招来的研究生科研能力都不够，以至于这些新人来的头一年仍在补课。
“国内本科生的聪明才智确实是世界一流的，特别是国内一流大学，比麻省理工、普林斯顿、斯坦福等国外名校的学生有过之而无不及，但创新能力却相对不足。”姚期智说，他在国外大学经常看到国内来的学生。但令人震惊并惋惜的是，这些来自国内一流大学的学生很多该学的没学，创新思维薄弱制约了他们的成长。因此，姚期智下定决心：给这些学生一个更富挑战性的环境。
2005年，清华大学计算机科学实验班“姚班”正式成立，姚期智主张，让学生发现自己最擅长做什么、最喜欢做什么，将来不管就业还是深造，都沿着这个方向去发展。
在他的主导下，“姚班”的培养方案、教学计划逐步确立完善，姚期智亲自主讲国内首个计算机理论课程，传授他最擅长的计算机算法设计和复杂性领域。重新构建的本科课程体系全面覆盖计算机科学前沿领域，并突出了与物理学、数学、经济学、生物学等多学科领域的交叉互补性。
多年来，“姚班”培养了大批青年才俊：他们当中有被誉为中国大学生计算机编程第一人的“楼教主”楼天城，有被选为福布斯全球30位30岁以下金融天才的邹昊，创立了光流科技的胡伯涛，还有旷视科技三位联合创始人印奇、唐文斌、杨沐。
“‘姚班’最大的收获就是把创新变成了习惯，上学时每周都会有老师介绍前沿领域和方向，探讨尚未得到解决的问题，这种思路被培养成了习惯，延续至今。”“姚班”毕业生、旷视联合创始人杨沐说。
姚期智说，他希望清华的环境能让大家减轻压力，更多感受到学习、研究过程中的挑战与突破，以及由此带来的幸福感。唯有这样，我们才能培养出世界最顶尖的创新者。
事实上，做出世界最顶尖科研成果的梦想，就像一粒种子，已经被姚期智播撒到每一位“姚班”学生和众多科研工作者的心里。
不离开科研一线
2010年年底，姚期智牵头成立了清华大学交叉信息研究院并担任院长。在计算机科学与技术和物理学两大学科方向交叉建院，在国内属于首创。
