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新研究：龟类也可能是新冠病毒潜在中间宿主(2)

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2020-02-28 13:38:34  观察者网

穿山甲 SARS 样 CoV SRR10168377 与蝙蝠 SARS 样 CoV RaTG13 仅具有 85% 的同一性。这表明如果只关注刺突 RBD，穿山甲 SARS 样 CoV SRR10168377 有可能越过宿主屏障感染人类。

类似 SARS-CoV 与人 ACE2 的结合，受体上的 31、41、82、353、355 和 357 位残基在与 SARS CoV-2 刺突蛋白相互作用时会定位到表面。

从具有ACE2受体41和353位的RBD域中的Asn501来看，龟类和穿山甲似乎比蝙蝠更接近人类。这表明龟类和穿山甲可能是SARS-CoV-2的潜在扩展宿主。

了解结构结合机制将有助于找到准确的病毒库，并有助于制定预防对策。通过冷冻电子显微镜紧急分析 SARS-CoV-2 刺突蛋白的结晶体，有助于验证 SARS CoV-2 刺突 RBD 与人类 ACE2 或其他宿主受体之间相互作用的结合点。

据报道，SARS-CoV-2刺突蛋白与ACE2的结合能力比SARS-CoV强得多。这表明SARS-CoV-2的中间宿主更多。

目前已知龟类作为病毒库，携带数十种病毒，包括虹蛙病毒（RV）、尼多病毒（NV）、乳头瘤病毒（PV）、甲鱼虹彩病毒（STIV）、甲鱼系统性败血症球状病毒（STSSSV）、龟细小核糖核酸病毒（ToPV）和中华鳖出血综合征病毒（TSHSV）。不能排除蝙蝠 SARS 样 CoV RaTG13 或其他 SARS 样 CoV 感染龟类，并在进化后向人传播。

从SARS-CoV和MERS-CoV到SARS-CoV-2，蝙蝠均是冠状病毒的天然宿主，但中间宿主却各不相同。此前研究表明，与其他动物相比，蛇因其同义密码子相对使用度（RSCU）偏向，很有可能是SARS-CoV-2的野生动物病毒库。

果子狸和单峰骆驼作为人畜共患病SARS-CoV和MERS-CoV的中间宿主，生活在不同的时空环境，但它们仍将冠状病毒传播给人类。这使得短期内找到SARS-CoV-2的中间宿主很难。

病毒受体结合序列和宿主受体的分析有助于快速靶向SARS-CoV-2可能的中间宿主。与非法交易的穿山甲相比，市场上的龟类更普遍受欢迎。

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