上合组织从安全领域的互信起步，倡导新型安全观，以合作促安全，从一开始就彻底摒弃冷战思维、强权政治；秉持开放的原则，不针对第三方，成员国结伴不结盟，不谋求建立军事政治同盟；强调大小国家一律平等的原则，尊重差异，协商一致，互利共赢，代表了区域合作的新方向，符合冷战以后地区各国求和平、谋发展的根本诉求。
机制建设的特色
上合组织成立后的第一个十年，是地区形势急剧变化的时期。美国及其盟友的反恐战争、一些独联体国家发生的“颜色革命”、全球性的金融危机，使地区格局发生深刻调整，但上合组织经受住了这些突发事件的考验，内部的凝聚力不断增强。通过建立起多层次的例行会晤机制，成员国保持了经常性的密切接触，通过对话、协商不仅解决相互间的分歧，而且对地区问题、国际事务能够形成共识、统一立场。
国家元首理事会是该组织的最高领导机构，负责研究、确定多边合作与活动的战略、优先领域和基本方向，通过重要文件。政府首脑（总理）会议每年召开一次，举办国总理担任主席；外长会议每年在元首峰会之前的一个月举行，地点与峰会一致；国家协调员理事会由成员国各自任命的国家协调员组成，为高级别的会议做准备。2004年启动了秘书处和地区反恐怖机构两个常设机构，领导人由各成员国轮流担任，充分体现了平等的原则。
为落实元首会议和总理会议的决议，推进各领域合作，上合组织还陆续启动了各部门领导人会议，在成员国轮流举行。截至目前，上合组织框架内已建立国防部长、经贸部长、交通部长、文化部长、教育部长、科技部长、农业部长、公安（内务）部长、安全会议秘书、总检察长以及执法安全、紧急救灾等部门领导人的会议机制。有的会晤机制下还设有高官会或工作组、专家组，负责具体实施合作计划或提供政策咨询。上合组织框架内还建立一些民间协调机制，如实业家委员会是联系成员国实业和金融界的非政府组织；银行联合体由成员国赋予全权的银行组成，旨在为经济项目提供资金支持。
6月10日，上海合作组织成员国元首理事会第十八次会议在青岛国际会议中心举行。习近平在会上指出：“上海合作组织成立近17年来，走过了不平凡的发展历程，成为具有广泛影响的综合性区域组织
