中小企业数量多、分布广，相当一部分位于工业集中区之外，离老百姓近，虽然单个企业污染物排放量不大，但排放扰民较多，群众反映较突出。由于环保部门力量有限，长期处于“小马拉大车”的超负荷状态，对查处或根治中小企业、特别是那些惯于与环保部门“打游击战”的小企业的环境违法现象，常常是有心无力。中央环保督察组在各地督察中，受理的信访投诉基本上都是由中小企业引起的。由于针对问题抓整改，给人的感觉便可能是环保督察只抓中小企业不抓大企业。
也有一些地方平时比较重视抓大企业，对存在诸多环境问题的中小企业睁一只眼闭一只眼，疏于管理。中央环保督察来了，只好运动式地狠抓一阵，猛药去疴。这同样给人一种环保督察只抓中小企业不抓大企业的错觉。
整改环保问题，是偿还以前粗放式管理的欠账，弥补过去没有依法监管的缺课，不能由此得出中央环保督察“抓小不抓大”的结论。在这一过程中，有的地方确实存在着方法简单、粗暴执法、“一刀切”的问题。但不应将这笔账记在中央环保督察头上。
环保部门对企业的环境违法行为就是应当零容忍，无论对大企业还是小企业，都要一视同仁严格依法查处，决不搞“看客下菜”。每一个企业都要严格遵守环保法律法规，合法排污、守法经营，谁都不要罔顾事实鸣冤叫屈，企图让政府“放一马”。
