目前，该基地驻扎着美陆、海、空军和海军陆战队，部署有P－3C反潜巡逻机、F－16战斗机等武器装备，常年保持着4000人的驻军规模，官兵定期进行轮换。主要遂行情报搜集、为非洲国家军队提供培训、打击海盗等任务。此外，美国为打击恐怖分子成立的“非洲之角联合特种部队”司令部也设在这里。
随着全球反恐战略的持续推进，美国认为，非洲是未步入全球化的“裂缝地区”，长期的贫穷和战乱容易使非洲成为“基地”组织和其他恐怖组织的根据地和避风港，可能会给美国带来安全隐患，甚至可能导致美国全球反恐战争功亏一篑。
基于以上考虑，美国将“非洲之角”和“撒哈拉地带”附近地区作为反恐的重点区域，而吉布提正处在美军反恐关注的核心地带。从吉布提美军基地向东南16公里就是索马里，美军无人机从该基地起飞，数分钟内就可飞抵也门和索马里上空，能够快速获取恐怖组织活动的情报信息，并实施精确“斩首”行动。
2012年，美军海豹突击队从吉布提基地出动数架直升机，成功解救了被索马里海盗绑架的美国和丹麦人质。此外，近年来美国频繁使用无人机对“圣灵抵抗军”和“伊斯兰青年党”进行精确打击，这些都充分体现了该基地的部署优势。
遏制其他大国在非洲的影响力，也是美国不惜重金打造吉布提基地的主要原因。近年来，世界各新兴国家都在积极寻求与非洲国家合作，增强自身在非洲的影响力。印度通过开展“援助换石油”计划，进一步强化了在非洲的软实力影响；巴西视非洲为“全球市场上最有利润、最有前途、最有竞争力的地区之一”，双边贸易额逐年增加；俄罗斯在其大国战略的指导下重返非洲，对非投资已经超过几百亿美元；中国同非洲国家之间的互利合作和贸易关系更是得到了长足发展。
世界各新兴国家与非洲国家关系的日益密切，引发了美国的焦虑和担忧。美国开始利用各种手段，扩大在非洲的影响力。军事介入便是其中重要的一环。近年来，美军不断加大吉布提军事基地的建设力度，扩充驻军员额，更新武器装备，并依托该基地强化与非洲国家的军事合作，企图以军事领域的渗透，抢占对非关系的制高点，同时削弱和遏制其他国家的影响力，为主导非洲事务增加筹码。
