LINE1基因研究逐渐步入正轨，最重要的是，桑托斯和珀查德找到了如何在老鼠胚胎中关闭LINE1的方法。DNA可以存储生命代码，但是要读懂它，细胞必须首先将DNA序列转换成RNA相关分子。当研究小组中立化LINE1RNA微粒时，受精卵首次分裂之后，胚胎就陷入双细胞阶段，没有LINE1基因，老鼠胚胎基本上就停止发育。
桑托斯认为，LINE1RNA微粒起到“分子胶”的作用，它将一组分子结合在一起，关闭了双细胞阶段，并推动其进入下一个发展阶段。特别是，它关闭了一种叫做Dux的基因，该基因在双细胞阶段处于活跃状态。
在过去几年里，其他研究小组曾偶然间发现LINE1基因功能的重要线索。他们发现LINE1基因在早期老鼠胚胎和大脑细胞中可能发挥的作用，但是他们并没有对LINE1基因功能提供确凿证据。美国南达科达州立大学LINE1基因研究员Wenfeng An说：“直到近期，关于LINE1基因的探索仍没有准确的定论，我们一直在期望着研究结果，这是一项开创性研究。”
然而，LINE1自我复制的通车与它在胚胎发育中的角色无关。当珀查德阻止LINE1插入基因时，胚胎干细胞看上去状态好。胚胎细胞有可能在制造LINE1RNA分子的同时，阻止它在基因组中潜在有害性“踊跃”。但是LINE1成千上万的复本中，不可能每一个复本都用于调控胚胎发育。
科学家下一步将重点研究人类细胞中的LINE1基因，它构成人类基因的17%。老鼠和人类存在着差异，但是LINE1基因也大量存在于差不多所有的哺乳动物。其他的转座子（也被认为是垃圾DNA）在人类细胞发育过程中也具有重要作用。美国斯坦福大学发展生物学家乔安娜·沃索西卡（Joanna Wysocka）之前也研究过LINE1基因，她说：“在所谓的垃圾基因中存在大量的‘宝藏’。”（叶倾城）
