第三个阶段称之为“能力导向”阶段，时间大致是从1997年到2012年。20世纪90年代开始，知识经济初现端倪，在智力密集型的社会，创新、创意将成为国家竞争力的核心元素。为此，新加坡的教育改革更加重视创新能力和探究精神的培养，于1997年开始推行名为“思考的学校，学习的国家”的教育改革计划。
进入21世纪，新加坡教育更是把学生不同的自然禀赋、才能、兴趣和特长看作重要的资源，充分挖掘每一个学生的优势，并且提供机会给他们进行充分展示。第四个阶段起始于2012年，可以称之为“以学生为本，以价值为导向”的阶段。这是2012年上任伊始的教育部长王瑞杰在教育部一年一度的工作蓝图大会上，向1800名校长、副校长和教育部官员提出的。在21世纪，未来世界的发展将呈现出越来越多“不稳定”“不确定”“复杂”“模糊”等特点。“以学生为本，以价值为导向”的教育旨在让整个教育系统变得更加以学生为中心，更加强调价值观、品格发展。价值包括“自我价值”“道义价值”和“公民职责价值”。“自我价值”给予学生自信心和自我意识，培养他们坚忍不拔的意志力；“道义价值”培养学生在多种族、多元文化的社会，尊重、负责、关怀和赏识他人；“公民职责价值”则培养学生成为坚强、有毅力、有知识、有见闻，国家有难，能奋起捍卫祖国的好公民。为此，新加坡教育部将“设立品格与公民教育组”，全面规划学生的品格教育课程，并且以重新界定“好学校”的定义、减轻教师行政工作量、修改针对学校的奖励计划等举措配合推进新的教育改革。
2、狠抓教学：在“思考的学校”中“少教多学”
先进的教育改革理念，如果没有引起教学实践的回应，终将难以为继。为了适应国家在不同阶段教育发展的战略定位，新加坡在教学上推出了一些举足轻重的改革，紧紧抓住教学这一关键环节，直指核心——学生的学习。在1997年教育当局提出“思考的学校，学习的国家”的计划中，学习被赋予了崇高的地位。其中，“思考的学校”强调学校要培养学生的创新能力和批判性思维能力，“学习的国家”则积极倡导国民要坚持终身学习，以迎接未来不断的挑战。
2004年，新加坡总理李显龙在国庆大会上演讲，提出要对教育进行变革，做到“教师少教一点，让学生多学一点”。2005年，新加坡教育部立即启动“少教多学”的改革。这一改革并不是要减少教师的教学量或者增加学生的学习任务，其宗旨正如时任教育部长所言，“少教多学是呼吁教师让学生真正沉浸到学习中，为他们的未来做准备，学习并非为了测试与考试，质量是少教多学的核心精神。”要“更少地依赖死记硬背的学习方式、重复的考试和缺乏个性的教学模式，而更强调从经历中发现，强调个性化教学，学习终身受用的技能，通过创新而有效的教学方式和手段塑造学生的性格。”这一论述不仅是对国家教育发展理念的具体回应，而且直指当时新加坡教育领域中存在的一些弊端，比如，在基础教育分流的压力下，学校教育的应试倾向非常明显，而其他未来社会发展所需的素养——学生的兴趣、自主学习的能力、创新的素养等常常被边缘化。
