深交所有关负责人认为，A股和H股存在市场价差的根本原因在于，内地与香港市场相对独立，股份不能相互转换，套利机制不畅。目前没有出现市场所预期的股价趋同现象，两地投资者在对方市场的参与度也较为有限，说明两地市场仍然相对独立。因此，短期内深港通消除市场价差的可能性较小。但从长远来看，随着两地互联互通机制的开展和深入，两地市场在投资者结构、投资理念、资金流动等方面将相互影响，联系日趋紧密，有助于逐步缩小市场价差。
滕印分析，虽然A股比港股估值更高，但不能就此简单说A股市场不理性，主要还是两个市场各自供求关系不同，市场化程度也不同。历史上，曾有过部分公司H股贵过A股，这要结合当时的市场情况综合看。但可以预期的是，未来A股市场会迎来更多制度性变革，伴随市场化程度提高，A股的估值也将更合理，两个市场的价差缩小是大势所趋。
田利辉认为，在我国经济和国际经济相对稳定的前提下，深港通短期内不会对A股产生太大影响。长期看，有助于减少A/H价差，增强价值投资理念，提高对于蓝筹和高增长型板块的关注度。实际上，深港通有助于提升深圳上市公司的国际化影响力，有利于增强企业发展和盈利能力，特别是中小板企业。而且，深港通为内地投资者提供又一个海外投资渠道，有利于投资者的资产配置和风险分散，是人民币国际化的新步伐。
此外，A股公司数量众多、行业覆盖相对全面，对中国经济的代表性更强。中金公司分析员王汉锋认为，A股市场仍对海外投资者有吸引力。海外机构投资者占比的逐步上升，有望在边际上改变A股市场以散户为主的投资环境，改变成交频繁、换手率高的投资风格，使A股市场更为理性、成熟。
而从中长期看，随着深港通不设总额度的互通机制诞生，对A股市场的很多深远影响将会逐步显现，比如交易策略和产品会更加多样化，监管理念和制度朝着更成熟、更国际化的趋势迈进。
投资风险如何防
要关注“老千股”、长期停牌等风险。应对之策在于谨慎投资，选择自己了解的股票标的
尽管与A股相比，港股的市场化程度更高。但在港股市场上，也有不少特有的风险陷阱是A股投资者不熟悉的。
“老千股”就是一直被高度关注的风险点。所谓“老千股”，并没有明确定义和量化指标，一般特征是业绩差、市值小、股价低；存在频繁合股、大比例低价供股或配股的行为；投资者权益可能被大幅稀释等。如威利国际，曾连续多年亏损，并屡次更名，合股不断。经过多次合股后，股东权益严重稀释。相当于1999年买入60多万股，到2012年仅拥有1股，而其间股价增幅很小。
一些港股公司长期停牌，也会给投资者带来很大不确定性。2015年5月20日，汉能薄膜发电因股价暴跌要求短暂停牌。7月27日，该股被正式从恒生大型股指数中剔除，调出沪港通标的范围。时至今日，已过去一年多，该股依旧停牌，香港证监会对其调查仍在进行中。港交所资料显示，该股78%的买入资金来自内地，内地投资者手中的大笔资金被长期冻结，鉴于香港市场的运行特征，相关投资者资金被深度冻结的时间可能会很长。
针对这些风险，深交所《风险揭示书必备条款》专门增加相应条款，进行特别提示。比如，对“老千股”交易风险，“提示投资者注意，部分业绩差、市值小、股价低的联交所上市公司存在频繁合股、大比例低价供股或配股的行为，投资者权益可能被大幅稀释，投资者应关注可能产生的风险”。对于股票长期停牌风险，“提示投资者注意，与内地证券市场相比，香港市场股票停牌制度存在一定差异，港股通股票可能出现长时间停牌现象，相关投资者应当关注可能产生的风险”。
