对小企业及私人作坊污染环境打击遇困难
一些小企业及私人作坊大多私设暗管或偷排，隐蔽性强，给监管部门执法带来一定困难。
“有人在废品收购站的大坑里加工垃圾油。”沈阳市公安局环境保护分局曾接到举报，称在沈阳经济技术开发区大清乡余粮村有人非法生产，污染环境。经查，在这个废品收购站内有一长７米、宽２米、深２．５米的大坑，坑内有黑色油状带有刺激性气味的液体。
环保部门出具的检测报告显示，坑内黑色油状液体为一种危险废物，共１２．７４吨。执法人员说，该深坑存在已久，如果不是群众发现并举报，很难端掉。
办案人员透露，当前对小企业追究环境刑事责任较为困难，只能查办个别人员，威慑力不足。在环境行政处罚案中，绝大多数的处罚对象都是单位，但在追究刑事责任时，绝大多数的处罚对象都是自然人，而刑事追究单位的责任经常出现证据匮乏的情况。
其中一个重要原因是，大多数污染环境罪的犯罪主体都是小作坊（电镀、皮革、冶炼、酸洗等），这种小作坊没有工商执照，打一枪换一个地方，只能作为自然人犯罪来处理。
治理污染环境犯罪需完善法律堵死角
根据《中国环境司法发展报告（２０１５－２０１７）》披露的情况：重金属超标３倍以上是当前最主要的污染环境犯罪入罪方式，达到１６３１件，占到将近７０％。如今，重金属超标成为污染环境犯罪的主要方式，已是环境刑事司法的重要特征。
受访的司法人员表示，总体上看，环境资源类犯罪发案率不均衡、入罪方式单一、刑罚整体偏轻。应该有针对性地完善刑事立法，提高环境刑事司法的专门化程度，同时进一步优化环境资源的行政管理。
中国法学会会员孙长江等认为，在办理环境污染刑事案件时，环保部门和司法机关面临的最大障碍是“鉴定难”。一方面缺少综合性的环境污染鉴定机构，另一方面鉴定检验周期长、收费高，与有限的办案时限与办案经费形成矛盾。为此有必要出台制度，明确鉴定机构、鉴定费用的负担机制及经费来源。
另外，建议细化污染环境犯罪的立法规定，将一些新型生态犯罪列入刑法调整范围。同时，重点加强对小作坊、涉污企业的检查，防止走过场。
