1995年，徐匡迪成为拥有“院士”资格的市长。2001年底，他调任中国工程院，第二年当选为中国工程院院长。
作为一名科学家，徐匡迪始终坚持高质量完成党和国家赋予的重要使命。近年来，他主持并参与了若干国家重大科技发展战略研究。在《中国新型城镇化战略研究(2004-2012)》中，他提出了“以人为本的城镇化”理念。
“城镇化不只是土地的城镇化，而是人的城镇化。”徐匡迪说，科学咨询工作容不得半点马虎，这项工作要求科技人员不仅要有卓越的专业能力，更要有使命担当。
如今，年逾八旬的徐匡迪担任着京津冀协同发展专家咨询委员会组长一职。“对于雄安新区，要有针对性地培育和发展科技创新企业，积极吸纳和集聚创新要素资源，培育新动能，打造具有重要意义的创新驱动发展新引擎。”徐匡迪说。
工程科技是推动人类进步的发动机。在长期对国家重要工程科学与技术问题开展战略研究的过程中，徐匡迪也有着清醒的认识：“中国与世界科技强国之间还有一些差距，我们现在有了若干大国重器，还要有更多大国精器。”
徐匡迪说：“我们会制造重型器械，但高端的精密器械少，很多核心和关键的精密元器件还是要从国外进口。这就如同肌肉强壮了、骨骼大了，但心脏和脑子还是跟不上。科研人员要瞄准世界科技前沿，甘于寂寞、只争朝夕，把创新主动权、发展主动权牢牢掌握在自己手中。”
一代人有一代人的奋斗，一个时代有一个时代的担当。
徐匡迪说：“国家的科技创新能有这样的历史性变革，最可贵的是信仰的力量。‘两个一百年’的奋斗目标，应该是新一代青年奋斗者的精神航标。用实际行动拥抱这个伟大的时代，才能让自己的梦想成真。”
