为推行金瓶掣签，乾隆还亲自撰写《喇嘛说》一文，详细陈明缘由，并亲自设计金瓶的形制和图案。这一章程得到包括达赖喇嘛、班禅额尔德尼和摄政等的衷心拥护。福康安在乾隆五十八年三月十三日给乾隆皇帝的奏折中说道：“达赖喇嘛等告称：我大皇帝保护卫藏，糜饷劳师，上烦天心，时劳筹划，廓尔喀畏惧投诚，从此藏地永远安静。又将藏中诸事立定规条，使僧俗永沾利益，共乐升平，感颂恩慈，难名钦服。唯有督率噶布伦、堪布喇嘛等，谨遵善后各条，事事实力奉行，一切事务悉由驻藏大臣指示办理，藏地大有裨益，黄教更可振兴。”

由于“钦定二十九条”是处理西藏地方重大事项的纲领性文件和法规制度，此后西藏的所有重大事宜均以该章程为准则进行办理，包括大皇帝特赐金瓶，用满、汉、藏三种文字书写灵童名字于签牌，由呼图克图和驻藏大臣在大昭寺释迦佛像前正式掣签认定转世灵童；邻近各国来西藏的旅客和商人，或达赖喇嘛派往域外人员，须呈报驻藏大臣衙门签发路证；设立3000名正规军队：前后藏各驻1000名，江孜驻500名，定日驻500名，前藏代本由驻拉萨游击统辖，日喀则、江孜、定日各地代本，由日喀则都司统辖；达赖喇嘛和班禅额尔德尼的收入及开支，驻藏大臣每年春秋两次进行审核；驻藏大臣督办藏内事务，应与达赖喇嘛、班禅额尔德尼平等，共同协商处理政事，所有噶伦以下的首脑及办事人员以至活佛，皆是隶属关系，无论大小都得服从驻藏大臣等，均得以贯彻落实。藏历铁虎年（清道光十年，1830年）清查形成的藏文档案资料《铁虎清册》也是依照“奉天承运大皇帝乾隆五十七年，为眷念西藏百姓之安乐，赐降谕旨，命政府、贵族、寺庙一律平均支纳差赋”。道光二十四年（1844）琦善的《酌拟裁禁商上积弊二十八条》也正是在“钦定二十九条”基础上修订完善的。

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