在天竺保税区内，北京市药监局对保税区内注册的北京企业全资子公司允许其使用子公司印章代替母公司企业印章办理通关，避免了子公司人员奔波于保税区和上级母公司之间，每单能为企业节省最多7个工作日。
对于部分首次进口药品和部分生物医药制品需要在上市前进行检验的问题，市药监局设立了专门通关备案窗口，药品到港后24小时内由药监人员现场完成抽样，就地“一站式”办理企业原需在市政务服务中心、市药品检验所和保税区仓库多地办理或履行的通关单、检验通知书和药品抽样等。
北京市还在全国率先推行进口药品“一次入库、多次通关”模式，允许进口企业将药品一次性进口通关、存放至保税仓库，分多次出库报关，分批上缴关税，满足企业资金回流快、税款占压少的资金周转需求。
目前，北京市药监局又将保税区内的通关服务范围由保税区内注册的企业扩大到所有在保税区有仓储业务的企业。这一优质服务，很快吸引了在上海口岸通关进口的15种药品转移至北京天竺保税区通关。
2019年通关药品将增20种
北京市药监局局长甘靖中说，针对我国加快境外已上市新药在境内上市审批、对治疗罕见病的药品和防治严重危及生命疾病的部分药品简化上市的要求，市药监局多措并举，以优质便捷服务降低了企业的通关成本，免除企业在进口通关过程中的后顾之忧。而为企业减负根本上是为了患者减负，服务企业正是服务患者。
目前，北京进口通关药品品种达到87种，其中罕见病、抗癌用等新药和特效药21个。保税区通关的肺炎沛儿十三价疫苗和宫颈癌四价、九价疫苗成为群众需求强烈的品种。
2019年1至2月入区医药产品中，进口药品通关较2018年同期增长了12%。据预计，2019年在此进口通关的药品还将新增20个品种，其中包括预防乙型肝炎的安在时（重组(酵母)乙型肝炎疫苗），同时预防小儿白喉、破伤风、百日咳、脊髓灰质炎和B型流感嗜血杆菌感染的潘太欣5联疫苗，以及全球“明星”疫苗产品带状疱疹疫苗Shingrix等。
