第三，机构改革是党治国理政的重要保障。从国家治理的角度讲，治国理政之大小事，无不通过机构和职能进行。国家治理体系和治理能力都是与机构和职能紧密联系的。机构改革事实上已成为国家治理的主轴和发展的路径。只有通过机构改革，才能更好地、全面地提高国家治理能力和治理水平。
以国家治理为导向的机构改革具有全新的目标领域任务
以国家治理现代化为导向的机构改革，决定着本次机构改革在改革的目标、改革的领域和改革的任务等方面，与以往历次机构改革相比，都发生了新变化。
首先，这一次深化党和国家机构改革的目标是，构建系统完备、科学规范、运行高效的党和国家机构职能体系。这是怎样一种体系呢？概括起来就是四大职能体系：总揽全局、协调各方的党的领导体系；职责明确、依法行政的政府治理体系；中国特色、世界一流的武装力量体系；联系广泛、服务群众的群团工作体系。简洁地说，就是党的领导体系、政府治理体系、武装力量体系、群团工作体系。弄清楚职能体系问题，是顺利、正确、有效推进机构改革的前提。这次党和国家机构改革就应在这四大职能体系要求下通盘考虑、进行改革，并要服务于构建四大职能体系。
其次，本轮机构改革要统筹党政军群机构改革。为适应建立四大职能体系的根本要求，就必然需要进行党政军群四大机构的系统改革。党政军群机构改革，是对此次机构改革的总体性概括，它大大超出了以往机构改革的范围。以往历次机构改革仅限于政府部门的行政体制改革，而此次机构改革涵盖所有机构，深入众多部门领域。具体而言，此次机构改革涉及五大领域，一是党政军群四大领域各自的机构改革，即党政军群要科学、合理设置各自的相关机构；二是第五个领域的跨领域改革，即党政军群之间机构改革的相互配合，将它们中职能相近的机构合并或合署办公，充分理顺和优化党的部门、国家机关、群团组织、事业单位的职责，更好地完善党政机构布局。
