北京时间2月9日,《柳叶刀》(The Lancet)在线发表了这项研究。文章作者表示,由于北京人口的特点以及高传染性新冠毒株在北京地区的传播情况,上述结果是中国大流行的缩影。
该研究由中国国家重点研发计划和中科院战略优先研究计划资助,由北京疾病预防控制中心、中国科学院、中国疾病预防控制中心和中国科学院大学的研究人员进行,北京市疾控中心副主任王全意与中国科学院院士、中国科学院微生物研究所研究员高福为通讯作者。
2022年11月14日至12月20日,北京地区发现的局部亚变异株。来源:柳叶刀
文章称,自2019年12月以来,本研究的作者定期收集北京地区输入型病例和本地新冠病例的呼吸道样本,并随机选择样本进行分析。在2022年12月之前,未有关于病毒在北京地区本地持续传播的报告。在这项最新研究中,作者对北京地区2022年检出的新冠病毒样本进行了分析。使用快速、大规模测序技术生成基因组序列,并使用现有的高质量新冠病毒序列分析其进化历程和种群动态。
研究共纳入2881个高质量序列(其中境外输入型病例来自63个国家和地区),在2022年11月14日(感染病例数量开始急剧增加)至12月20日期间,随机选择了413个新样本进行测序。其中350例为本地病例,63例为输入型病例。
对413个新序列的分析表明,其均属于现有已知的新冠毒株。2022年11月14日之后,北京地区的优势毒株为BF.7,占本地感染病例的75.7%。另一种奥密克戎变异株亚分支BA.5.2占本地感染病例的16.3%。同期输入型病例涉及毒株包括BQ.1和XBB.1,分别占20株和6株,它们是国际间占主导地位的变异株,但在北京本土感染病例中并未检出。
左图为2022年全年在北京流行的新冠病毒变异株的组成,右图为2022年11月14日之后在北京传播的新冠病毒变异株的组成。 内圈代表分支的组成,外圈代表每个分支中的详细谱系(Pango lineage)。来源:柳叶刀
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