基因测序证实猴痘已在欧洲发生大规模社区传播(2)
此前，葡萄牙国家卫生研究所的约翰.保罗.戈麦斯（Joo Paulo Gomes）及其同事已公布了10份葡萄牙猴痘患者携带的猴痘病毒基因组测序报告，并分析指出，本轮猴痘疫情暴发极有可能来自一个源头。
当地时间5月27日，意大利研究团队公布了第一份意大利猴痘患者的病毒样本基因组测序报告。该33岁男子5月18日由葡萄牙抵达意大利,因肛周溃疡、双边腹股沟淋巴结肿大、双肘部、背部、臀部和左脚少量丘疹和水泡性皮肤病变前往当地医院就诊，出现皮损前几天，患者发热(38.5°C)持续一天，伴有咽痛和打喷嚏。研究团队对该病例携带的病毒样本基因组测序使用了Illumina平台，测序深度为19倍。分析结果显示，该患者携带的猴痘病毒基因组属于西非进化支，与葡萄牙团队上传的基因组样本关系极为密切。
同一天，西班牙团队公布了西班牙第一份猴痘病毒样本基因组测序报告。基因组草图的覆盖率为98.6%，平均测序深度为77倍。该病毒基因组同属猴痘病毒西非进化支，与关系最密切的葡萄牙一支序列相比，单核苷酸多样性位点(SNPs)小于4个，与德国序列相比，单核苷酸多样性位点(SNPs)为2个。
荷兰的研究团队在此前一天，公布了首份荷兰猴痘病毒样本基因组序列报告，团队使用了Nanopore基因测序平台，测序深度为10倍。研究者在报告中称，病毒在进化树上与此前葡萄牙团队公布的基因组样本极为相似，与关系最为密切的一份葡萄牙样本相比，只出现了2个单核苷酸多样性位点(SNP s)。
此外，来自法国的第一份病毒基因组序列，比利时的第二份病毒基因组序列都表现出了与葡萄牙最早公布的基因序列极高的相似度，且都属于病毒基因进化树上的西非分支。
意大利研究团队进一步表示，“目前的基因组测序结果进一步支持了这样的结论，即猴痘病毒在欧洲已经发生了大规模的社区传播。”
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