在做强战略性新兴产业的同时，合肥高新区构建梯度式产业结构，做优基础制造产业、做大高新技术产业，推动经济产业结构优化。“以家电、汽车等规模制造为基础，以光伏、电子信息等战新产业为中坚，以集成电路、精准医疗等先导产业为引领”的创新型现代产业体系形成，家电、电子信息、光伏新能源、汽车及装备制造4大产业均已形成规模超300亿元的产业集群。
目前，合肥高新区5000多家企业设立专职科技研发部门，国家高新技术企业达603家;2016年新增知识产权1.7万件，万人有效发明专利达261件，是全国高新区平均水平的2.1倍。
推进平台建设
合肥高新区以产、学、研、用一体化为导向，建设协同创新平台集群。国际一流的创新平台成为创新创业的“发动机”
2017年1月10日，国家发展改革委和科技部批复了合肥综合性国家科学中心建设方案。围绕这一方案，合肥高新区承担了量子信息国家实验室、超导核聚变中心、天地一体化信息网络合肥中心、离子医学中心、分布式智慧能源创新平台等5大平台建设，同时也积极参与联合微电子中心、大基因中心两个平台的建设。
作为核心承载区，合肥高新区主动作为，成立“推进合肥综合性国家科学中心平台建设服务小组”，每个平台项目都由一位管委会副主任负责推进，进行调度。目前，离子医学中心已经全面开展研发工作，离子源、超导磁体、射频系统、降能器等关键部件和子系统陆续通过测试，计划2017年底研制完成大部分部件，进行整体装配。
合肥高新区以产、学、研、用一体化为导向，在全国范围内率先建设协同创新平台集群。合肥高新区已成功引进广州生物院、工信部五所等平台项目；正在洽谈引进国家信息安全测评中心、合肥先进光源、大气环境污染检测先进技术与装备国家工程实验室、中国航天员科研训练中心等项目；继续建设提升中科大先进技术研究院、中科院合肥技术创新工程院等协同创新平台，构建覆盖企业成长全周期的创业孵化服务体系和科技创新服务体系。国际一流的创新平台成为合肥高新区创新创业的“发动机”。
汇聚创新资源
合肥高新区吸引科技服务机构入驻，并实施一系列政策推动人才、资金等创新要素集聚，实现园区创新发展
