截至2016年12月31日，持有厦门银行5%以上股份的股东共有4家。厦门市财政局持有其25.60%股份，是该行大股东；富邦银行(香港)有限公司持有其19.99%的股份，是厦门银行2008年引入的战略投资者；北京盛达兴业房地产开发有限公司持有其13.49%的股份，是该行2014年引入的战略投资者；佛山电器照明有限公司持有其5.85%的股份。
尽管厦门银行多次进行增资扩股，但其资本充足率却不断下滑。据统计，自2014年以来厦门银行核心资本充足率持续下降。2014-2017年一季度，厦门银行资本充足率分别为11.59%、12.36%、11.75%和11.23%，一级资本充足率和核心一级资本充足率都分别为10.33%、9.55%、8.94%和8.19%，持续下跌。
2016年定增不超过5亿股股份方案获银监会通过后，2017年上半年，该行又接连2次发行二级债券共22亿元。厦门银行称，募集的资金将用于充实二级资本，提高资本充足率，以增强营运实力，提高抗风险能力，支持业务持续稳健发展。
台资背景
厦门银行想要在A股上市也并不容易，对比其他排队中的银行，该行在资产规模以及利润等方面并没有明显的优势。
截至2016年末，厦门银行总资产1889.72亿元，同比增长17.87%；其中零售贷款增长明显，实现余额127.8亿元，同比增长65.87%，占全年贷款增量43.75%。
厦门银行的零售业务对台特色业务进一步发展。富邦银行(香港)有限公司是厦门银行的第二大股东，其19.9%的股权已经转移给台北富邦银行，因此，厦门银行有着独特的台资优势，是大陆首家也是目前唯一一家具有台资背景的城市商业银行
该行称：“在服务台商方面，本公司持续推动内保外贷、内保外债及外保内贷等联动业务，发挥本公司两岸金融平台优势，更好地满足台商的金融需求。”
盈利方面，厦门银行2016年实现净利润10.33亿元，同比增长16.07%。但是该行资产利润率和资本利润率双降，2014-2017年一季度，厦门银行资产利润率分别为0.67%、0.66%、0.61%、0.57%，资本利润率分别为13.22%、12.29%、11.94%、11.62%。厦门银行表示是受到宏观经济的影响。
厦门银行资产质量存在不小的压力，不良贷款率连续三年上涨，2014-2016年末不良贷款率分别为1.09%、1.37%、1.53%。截至2017年一季度，该行各项贷款及垫款总额516.1亿元，贷款损失准备17.31亿元，较去年年底增长7.6%。
