他于20世纪70年代回到巴基斯坦,主持成立了巴基斯坦第一座核实验室。1998年,他监督开展了巴基斯坦第一次核试验。巴媒称,他的努力帮助巴基斯坦获得了“应对印度威胁”的能力。
2004年,卡迪尔·汗曾向公众承认,他在没有获得巴基斯坦政府同意的情况下向多个国家泄露核技术。他得到了时任巴基斯坦总统穆沙拉夫的赦免,但被软禁在伊斯兰堡的家中。2009年,法院解除了对他的软禁,但他的行动依然要受到严格的监控。
卡塔尔半岛电视台称,在西方国家将卡迪尔·汗视作“从事核扩散的危险人物”的同时,相关争议却并未影响他在巴基斯坦的人气。他过去时常为巴基斯坦的主流媒体撰写文章,宣传科学教育的重要性,巴基斯坦多地的学校、研究所和慈善医院也以他的名字命名。