上世纪冷战期间，巴美关系密切。9·11事件后，巴基斯坦参加国际反恐战争，参与打击塔利班和“基地”组织，积极参与阿富汗重建。
美国奥巴马政府上台后出台对阿富汗、巴基斯坦新战略，加大对巴基斯坦军事和经济投入，但两国间互信不足。2011年，受本·拉登在巴基斯坦境内被击毙、美北约越境空袭巴基斯坦边境哨所事件等影响，巴关闭境内北约后勤补给线，一度中断同美高层互访，两国关系降至低点。
2012年以来，两国高层逐渐恢复接触，关系逐步得到改善，并于2014年3月重启巴美战略对话。
2016年1月，阿巴中美四方协调组首次会议召开，致力于推进“阿人主导，阿人所有”的和解进程。
