“截击”网站获得的2013年5月的一份文件显示，美军无人机暗杀行动分为两个部分。首先，要在目标区域“形成一个目标”，并要获得“暗杀这一目标的授权”；第二个部分是从“授权”到“行动”。
依据流程，美军情报分析人员首先绘制涉恐嫌疑人肖像，分析他们构成的威胁，制作这些人的“个人简历”。然后，这些简历经高层核定放入“打击篮子”。文件显示，JSOC48-4特别任务组的情报人员会与其他情报部门的情报人员合作，建立一个针对特定目标的详细档案，为目标制定一个类似于“棒球球员卡”的卡片。这些针对特定目标的档案盒卡片将会通过相关工作人员“层层上交到高级领导层，并最终到达美国总统手中”。
记载着暗杀目标的档案，首先会到达掌管目标区域的指挥官手中，比如掌管也门以及索马里的地区指挥官手中。随后，文件会被提交到国防部官员手中，然后由一组来自国家安全委员会的顶级顾问对档案进行评估、鉴定和分析。目标一旦选定，将上报奥巴马签字。美国总统平均花费58天签发针对一个目标的打击命令。接下来，美军有60天的行动时间。
“截击”网站还指出，通过他们所获得的文件可以看出，奥巴马签署后，美军才能将嫌疑人员定为打击目标，并启动暗杀行动。有报道曾指出，奥巴马曾签署过在阿富汗以及巴基斯坦外围开展的无人机暗杀行动。“截击”网站总结说：“无论如何，我们获得的文件与奥巴马在2012年对无人机行动的评论是一致的：‘最终是我要对这一行动及其过程负责。’”
决策人员
希拉里参与暗杀决策过程
从“截击”网站公布的资料来看，美军无人机的决策层共涉及23名政府高层官员。
其中，美国2016年总统大选民主党头号热门候选人希拉里·克林顿曾作为国务卿参与决策。决策层还包括美国驻也门大使以及也门总统阿卜杜勒·拉布·曼苏尔·哈迪，后者负责为美军的暗杀执行计划提供必要的协助。此外，美军的无人机暗杀行动中，最受重用的人物还包括自2013年起担任美国中情局局长的约翰·布伦南。
不过，“截击”网站也指出，在2013年后半年，白宫突然决定收紧在也门的无人机暗杀计划。一旦某项无人机暗杀计划得到奥巴马授权，联合特别军事行动组会获得为期60天的行动时间。在这60天里，联合特别军事行动组需要完成打击行动，还要获得美国地区作战指挥部、美国驻当地国家大使以及美国中情局分管该区域领导的同意。
曾执行美军在也门无人机暗杀计划的马克·麦克利透露，对于那些极端重要的打击目标，比如针对“基地”组织支持者和招募者、美国公民安瓦尔·奥拉齐的暗杀行动，计划每一步都需要美国军方、情报部门和政府高官的授权。麦克利最近出版了一本书讲述他在无人机行动中的经历，他解释说，“除了核心决策层，我们还拥有一支补充决策队伍，这些决策者都可以全程监控无人机打击项目的进展，暗杀行动从开始到结束都在监视范围之内。”在整个打击过程中，如果有一票否决，整个暗杀计划就要立即停止。
当无人机启动暗杀行动后，暗杀目标所在国的态度也极为重要。索马里国家安全部部长阿布瑞扎克·奥马尔·穆罕默德对“截击”网站表示，美军一般会在计划执行前提前告知目标所在国打击计划，有时候也会一边采取行动一边告知所在国打击计划，基本不会出现先斩后奏的情况。不过，也有媒体报道，美军并不是每次都会提前告知行动所在国打击计划，有时是为了避免泄密，有时是惧怕行动所在国不配合打击。
