中国社科院台湾研究所研究员王建民说，修正案规定对两岸协商严加审查，或许预示着蔡英文上台后两岸的协商将变得几不可能，在客观上会阻碍两岸关系的顺利发展；尤其是如果把“公投”要求写进修正案中，就会变成长期性的东西，一旦涉及重大协议，如两岸统一问题等，就会直接阻碍两岸的协商。
可以预见，修正案提案如果闯关成功，两岸关系将面临大变局。因为“两岸协议监督条例”之类的东西，跟它比起来都是小巫见大巫。
“改变现状”将“地动山摇”
国民党“立委”赖士葆总结说，若此“公投法”修改草案通过，将出现两大问题。首先，里面包括最敏感、大家最不愿意看到的“领土变更”，很明显就是走向“法理台独”。其次，两岸未来的任何协议要先经过“公投”才可以谈，大概什么都谈不成。
修正草案初审通过正在“5·20”前夕，时间点不可谓不敏感。大陆台湾问题专家徐博东此前就撰文提醒，如果“公投法”修订通过，两岸关系势必“地动山摇”！
在徐博东看来，20多年来，以民进党为首的岛内势力为推动“台独”可谓处心积虑，不遗余力。近年来发生的“太阳花”和“反课纲微调”运动，以及弥漫于台湾社会“防陆”、“反陆”、“仇陆”的不正常氛围，说明“台独”基本教义派所追求的“台独”路线图，业已进入了“政治台独”的新阶段。如今，更欲趁民进党“完全执政”的大好机会，图谋下修高门槛的“公投法”，再选择适当时机，通过所谓“住民自决”，最终实现“法理台独”。说穿了，图谋修改“公投法”，乃是妄图实现“法理台独”的前奏曲。
再过几天，新当局就要上台。有人说，两岸关系正面临前所未有的“不确定性”，甚至预见两岸列车不乏对撞的可能。赖士葆预测，蔡英文到最后可能会对“公投法”修正案“踩刹车”或者做若干的修正。但不管如何，两岸持续缺乏互信和交流，和平沟通的力量和声音自然就会减弱，要求强硬的力量和声音就会抬头。“冷和平”也罢，“冷对抗”也好，都绝非两岸之福。甚至如果“台独”势力跳出来主动挑衅力图“改变现状”，“地动山摇”可能就真的不远了。
