但是，经警方调查，德司达的多名员工说出了真相，民警还拿到了有数据拷贝的优盘，之后涉案人员陆续被查获。
江苏省高邮市检察院提起公诉，将德司达(南京)染料有限公司列为污染环境罪的单位犯罪主体。高邮市法院一审认为，在污染环境共同犯罪中，德司达公司和王占荣起主要作用，是主犯，应当按照其所参与的全部犯罪处罚，并判处德司达公司罚金2000万元，相关人员判处相应的缓刑到4年不等的刑罚。
后德司达公司上诉，认为犯罪行为是公司员工个人所为，公司不应承担相应责任。二审法院审理认为，王军作为德司达公司的员工，受公司负责人的指派联系处置废酸事宜，代表的是德司达公司并且是为了公司利益，经公司负责人确认后明知王占荣没有处置资质仍委托处置危险废物，减少了处置费用支出，王军的行为就是代表了公司意志。事发后，德司达公司为了逃避检查和追责，由公司负责人指使相关部门掩盖相关痕迹和证据的行为，进一步印证了王军、黄进军履职的行为就是代表公司的意志。
2016年10月8日，江苏省扬州市中级法院终审维持原判。
谁污染 谁埋单
公益机构索赔环境修复费，但地下水污染等环境损害难以计量
这个环境污染案件引起了江苏省环保联合会的注意。该联合会秘书长王玉华介绍，江苏省环保联合会跟踪这起案件已经有两年之久。
王玉华说，扬州市中院的终审判决中罚没的2000万元，其实主要是缴获了德司达公司在该刑事案件中的违法所得，综合造成的环境污染后果作出的判罚，这2000万元是收缴国库，并不会用来环境修复。因此，江苏省环保联合会向南京市中级法院提起诉讼，要求德司达公司赔偿环境污染修复费用2428.29万元。
这是怎么算出来的？据江苏省环保联合会的律师孙怀宁介绍，在扬州市中院的终审判决中，采纳了江苏科技咨询中心出具的污染环境损害评估技术报告结论。该中心认为，德司达的生产过程必然产生废酸液，其中硫酸平均浓度为59.34%。报告显示，以2000元/吨作为本案单位虚拟治理成本，并结合受污染影响区域的环境功能敏感程度取4.5倍率，因此得出2428.29万元的环境修复费用。遗憾的是，由于偷排长期、分散、多处发生在河网密度高、水系丰富的河流中，经扩散、稀释、中和等作用，已无法截获并计量被污染河流水体的水量以及水质数据，对水生态环境、水生生物、岸边土壤及地下水资源污染等导致的环境污染损害难以计量。
王玉华说，刑民并罚是该案的一大特点，目的是让环境污染者付出巨大代价。由于该企业违法处置危险废弃物废硫酸造成的污染事实已经造成，要修复到之前的环境水平必然要有相关费用产生，德司达公司作为主犯必须为此付出代价。
