同时，北京还将“南水”回补地下水源地，其中累计向潮白河水源地存水约2亿立方米，补水区域地下水位平均升幅增大。
效益三：“南水”源源不断补充，促进地下水资源涵养和恢复
多年来，北京因用水需求巨大不得不超采地下水，造成地下水位下降。而受益于源源不断补充的“南水”，北京近年来逐步关停自备井、大幅压采地下水，有效促进了地下水资源的涵养和恢复，遏制了地下水水位下降速度和漏斗面积进一步增大趋势。
监测数据显示，2016年北京平原区地下水埋深首次出现回升，年末水位较2015年同期回升0.52米；2018年9月末比去年同期则回升2.12米。
北京市南水北调办表示，目前北京正大力推进一批京郊水厂及大兴支线、河西支线等重点工程建设。随着配套工程陆续建设完成，全市接纳南水北调来水能力将进一步增强，北京城市副中心、北京大兴国际机场等重点区域和房山、大兴、门头沟的供水安全保障也将进一步提高，南水北调工程效益将得到进一步发挥。
经济日报-中国经济网天津6月4日讯南水北调工程意义深远，综合效益远超预期。如今，南水北调已成为天津市至关重要的供水来源，其生态供水更是极大改善了海河水环境，为天津市绿色健康发展提供有效助力。
