针对提高出差乘坐交通工具等级的问题，对2013年以来总局机关和所属单位超标准乘坐交通工具的问题进行了全面清理，清退超标准乘坐交通工具1102人次、39.26万元。
针对中国煤炭工业协会滥发津补贴的问题，协会制定了清退方案并报总局党组同意后，对违反规定兼职取酬的18人和其他中层及以上人员22人领取的奖金予以清退。发现问题的5个省级煤矿安监局和6个总局直属事业单位均已全部清退；总局管理的协会学会和中国煤炭工业协会都开展了自查并组织清退；有6个省级煤矿安监局发现管理的协会学会有问题，也组织了清退。
煤炭协会三年开全国性会议119次
整改协会学会干政扰民的问题方面，针对2013年以来中国煤炭工业协会发文650次、召开全国性会议119次的问题，责成中国煤炭工业协会进一步精简会议、文件，规范会议管理。督促其他协会学会修订完善有关会议制度和公文管理规定，严格控制会议和发文数量。
针对职业安全健康协会违规开展安全社区评审收取费用的问题，责成中国职业安全健康协会对违规收费问题进行自查，上缴违规收取的评审费用共计104.53万元（税后）。督促其他协会开展自查，其中中国索道协会存在开展安全生产标准化评审违规收费问题，自2013年底以来共收取117家企业评审费用431.94万元（税后），该协会立即停止了违规收费行为，将结余161.01万元依规上缴国库。
针对广西煤矿安全技术协会开展安全生产条件现场核查向煤矿收取费用的问题，广西煤矿安监局已要求广西煤矿安全技术协会全面停止煤矿安全核查工作，对违规收取的129.18万元，已退还相关煤矿124.18万元，剩余5万元正在联系退还。
针对一些协会学会向总局机关要钱、从分支协会收钱，一些在协会兼职的老领导自定薪酬、违规取酬的问题，印发管理办法，严格政府购买服务和委托事项管理。督促各协会学会制定接受委托业务的相关管理办法，进一步形成规范管理工作体系。某协会原理事长已将违规取酬全部退回。
针对事业单位、协会学会存在种种顽疾的问题，出台了管理办法，加强对直属事业单位的管理，积极稳妥地推进总局所属协会学会脱钩工作。目前，中国烟花爆竹协会已完成脱钩；中国索道协会脱钩实施方案已经总局党组会议通过，将于2017年8月前完成；其他协会学会脱钩工作正在有序推进。
针对8个全国性协会领导都在总局机关办公的问题，根据情况分类做出处理。针对中国煤炭工业协会、中国职业安全健康协会、中国安全生产协会3家协会牌子与总局牌子并列悬挂，突出行政色彩的问题，2016年10月26日撤下在总局办公大楼门前悬挂的3家协会牌子。组织全国26个省级煤矿安监局进行自查，存在类似问题的黑龙江、安徽、山东、甘肃煤矿安监局已将办公楼前悬挂的协会牌子撤下。
针对中国职业安全健康协会现有42人中有16人从事业单位、企业借用的问题，中国职业安全健康协会对从总局直属事业单位、企业借用的16人进行全面清理，其中与13人解除借用关系、退回原单位，1人自愿解除与原单位的劳动合同、以合同制身份继续留在协会工作。
■其他整改
湖北省
政策性住房违规多占全省共清退1412套
湖北省委在整改通报中提出，已对“擅自召开党委会、提名自己任党委书记”问题进行严肃调查核实。省直机关工委迅速调查核实情况，对有关问题处理情况进行通报。
关于选人用人问题突出，进一步规范核定省、市政府副秘书长职数，核减了超配的3名省政府兼职副秘书长职务。市（州）人大常委会配备的6名正厅职副主任和直管市1名人大常委会副主任（副厅），将结合换届全部消化。责成省编办就越权违规审批问题作出深刻检讨，并将黄石、襄阳、宜昌、荆州、鄂州、孝感等6家开发区管委会规格由副厅级调整为正县级。武汉临空港经济技术开发区与武汉市东西湖区实行了“区区合一”体制，管理机构已经消化。制定了建立干部职数管理台账的办法和进一步规范机构编制和领导职数审批管理工作的意见，切实规范机构编制和领导职数管理。
