打开圆拱小门，记者随工作人员进入墓室，地上6个墓室房屋空荡而洁白，像是毛坯房，只是形状是特有的梯形。迎面是只能容纳一人的小楼梯，蜿蜒而下，是地下墓区。目前，地下六室中，一室已放满骨灰，用水泥墙整体封存，不能打开。据工作人员介绍，每一室可存放骨灰3000余份，“封存的这一间已经放满了。”
另外两室各放了一半骨灰，其中一室门楣写有“居士室”三字。走进墓室，骨灰均整齐地安放在深褐色的金属制骨灰罩中——大小和样式都如同银行的保险箱。一个骨灰罩大约高40多厘米，从下往上，层层码起，一共码9层，顶上还有二三十厘米的空间。一层码满，再码一层。
骨灰罩内可放置一个骨灰盒，此外还有足够的空间摆放祭品和逝者生前酷爱的小物件，比如烟酒或者糖茶。
一个墓室大概可以安置3000余份骨灰，整个怀思阁可以放置4万余份骨灰。室内有巨大的通风管道，照明也很好。墓室层高4米多，因此并不让人感到恐惧和压抑，即使面对着已经码满三层的巨大骨灰墙，在第一印象中，也很难把这里跟“地穴”二字联系在一起。
存放一份骨灰收费500元，存放期50年，换言之可以理解为“永久保存”，但因用水泥封存，骨灰不能取出。目前整个怀思阁已安放4100余份骨灰。
怀思阁也是北京唯一一个“不问户口”的政府补贴殡葬方式，只要是中国人，都可以将骨灰安放在怀思阁内。
