文化学者经常感叹，保护古村落甚至比保护故宫还难。不仅因为古村落的保护涉及建筑、文化、经济、社会、观念等方方面面，也不仅因为人力、智力、财力资源匮乏，更是因为在“过度商业化”和“文化空心化”的双重挤压下，古村落失去了“烟火气”的滋养，一些原有的特质文化已经在走向消亡。
对于传统村落的保护，各地的保护方向往往更加重视有形建筑的修缮保护，而忽略了对无形的传统村落文化遗产的保护。在这样的保护认识与理念下，传统村落将可能变成一个个没有文化灵魂的建筑 “标本”。
古村落保护问题归根到底是文化延续出现了断裂，不少 “文化遗产”正在变成 “文化遗憾”。不少“保护”的传统村落，传统的、充满人文关怀和民族智慧的手工艺、非物质文化遗产，正在被无度地商业化，传统文化被商业利益所抽空或取代。与“过度商业化”形成鲜明对比的是许多农村正在经历“空心化”，除了许多村民外出打工，村庄无人居住，还有许多传统村落原有的特质文化已经消失，造成“文化空心化”。
传统村落的保护和发展就像天平的两端，如何为其加上平衡的砝码依然是个难题。保护古村落不可能拒绝发展，但又不能盲目发展。古村落建设，只有适度开发，因地制宜发展特色产业，才能让村民安居乐业，才能延续生命力。显然肇兴侗寨多元的文化传承和产业化的和谐发展之路，为其他古村落的保护提供了可复制的样本。
虽然肇兴侗寨早已开发旅游，各种商店和旅馆比比皆是，原本偏远的村寨，摇身变为旅游景点，现代商业为寨子注入了新的韵味。但是和国内其他著名古镇的过度商业开发不同，肇兴古镇在原生态和商业文明、文化保护和市场开发之间找到了平衡。
“望得见山、看得见水、记得住乡愁”，这大概是我们对传统村落的期待。肇兴抓住了现代人对乡愁的集体追忆与缅怀,通过保存完好的侗族传统村落布局、质朴的侗族传统生活气息和多元的侗族传统文化习俗共同凝聚的文化张力，将过去与现在、传统与现实、陈旧与新鲜自然而然地融汇在一起，并让历史上曾经出现过的材料、工艺、形式,在新的时代背景下又重新获得审美价值。
