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学校建有12个国家级人才培养模式创新实验区和12个国家级工程实践教育中心,每年立项各级大学生科研训练计划项目1500余项,组织参加各级各类学科竞赛90余项。
拥有两院院士12人,长江学者(含长江学者青年学者)55人,海外高层次人才引进计划入选者49人,国家高层次人才引进计划入选者16人,国家杰出青年科学基金获得者43人。
在教育部第三轮全国学科评估中,东南大学12个学科进入全国前七,10个学科位列全国前五,3个学科位居全国第一。10个学科进入ESI全球前1%。