防控金融风险也是经济学家们对此次全国金融工作会议最为关注的内容之一。会议强调，防止发生系统性金融风险是金融工作的永恒主题。要把主动防范化解系统性金融风险放在更加重要的位置，科学防范，早识别、早预警、早发现、早处置，着力防范化解重点领域风险，着力完善金融安全防线和风险应急处置机制。对此，中国国际经济交流中心副总经济师徐洪才认为，目前确实存在潜在的金融风险，不可低估，要高度重视。
徐洪才称：“比如说美联储加息，资本流出，人民币贬值，外部冲击的风险；第二国有企业杆杠率过高，负债率过高，民间投资积极性没有充分发挥，国有企业通过借钱投资，债务累累，有潜在风险；第三是影子银行体系过去发展太快，近几年好一点，非标准化理财产品、资管产品雨后春笋般的出现。第四是互联网金融体系过去一年也很热闹，出现了P2P融资平台跑路的情况，最近两年好一点了，通过清理整顿。未来我们还要发展 发展的过程中肯定还有潜在风险。还有地方政府借钱，有扩张的冲动，这也是潜在的风险。”
此次全国金融工作会议也给出了防范化解这些潜在金融风险的措施：把国有企业降杠杆作为重中之重，抓好处置“僵尸企业”工作。严控地方政府债务增量，终身问责，倒查责任。坚决整治严重干扰金融市场秩序的行为，严格规范金融市场交易行为，规范金融综合经营和产融结合，加强互联网金融监管，强化金融机构防范风险主体责任等等。
全国金融工作会议还提出，强化金融监管的专业性、统一性、穿透性，所有金融业务都要纳入监管，及时有效识别和化解风险。清华大学国家金融研究院副院长朱宁表示，短期风险的化解有助于预防整个系统性金融风险，比如及时防范处理交叉性金融风险。
朱宁说：“我们必须要看到，各种金融领域之间的相关性，比如去年宝能和万科这个事件里我们看到，保险、银行、证券、信托这些行业其实在某一个具体交易上，他们是紧密联系在一起的。随着整个金融工具的进一步发展，金融领域的风险是越来越高度关联，所以各个业态、各个产品之间的相关性风险的累加传导是值得我们高度关注的。”
此次全国金融工作会议强调，要坚定深化金融改革。其中备受关注的是要加强金融监管协调、补齐监管短板。为此，中国将设立国务院金融稳定发展委员会，强化央行——中国人民银行宏观审慎管理和系统性风险防范职责。中国人民大学重阳金融研究院客座研究员董希淼分析认为：“这一次的金融工作会议专门成立了国务院金融稳定发展委员会，应该说与原来的金融监管协调部际联席会议相比，它的职能更加完整，它的层级更高，将会把金融监管协调作为其重要的工作内容之一。同时呢，我们注意到，这次会议强调，要强化中国人民银行在宏观审慎管理和系统性风险防范方面的职责，应该说人民银行，在金融监管中的作用和角色将会越来越重要。强化了人民银行两个职责，宏观审慎管理和系统性风险的防范。”
此次全国金融工作会议还强调要扩大金融对外开放，提出要深化人民币汇率形成机制改革，稳步推进人民币国际化，稳步实现资本项目可兑换，推进“一带一路”建设金融创新，搞好相关制度设计等等。
