据美国有线电视新闻网（CNN）报道，美国海军11月1日发布“菲茨杰拉德”号和“约翰·Ｓ·麦凯恩”号两起撞船事故的调查报告，认为“事故本可以避免”。报告称，两艘军舰的指挥官在“判断和指挥上有许多失误”，但事故责任不全由一人承担，当值士兵也存在诸多过失。
美国海军在调查后发现，导致事故发生的主要原因包括：军舰人员缺乏足够的安全意识，未采用声波导航，当值人员失察，未能正确使用导航设备，相关人员缺乏有效应对能力。报告称：“指挥官糟糕的判断和决策导致事故发生。但是事故责任不全由一人承担。由于指挥和管理不力、训练和准备不足，军舰士兵不具备应对突发事件的能力。”
调查人员发现，美军士兵在事故发生时反应迟缓。甲板上的当值士兵起初并未采取任何行动；等到发现两船相撞时，为时已晚。美国海军表示，尽管货船也没有及时采取行动，但“菲茨杰拉德”号对事故负有主要责任。
根据美国海军报告，“约翰·Ｓ·麦凯恩”号在事故中的主要过失为：无法正确处理航行中的操作失误，未能遵循国际航海规则，一些船员未能熟练掌握军舰系统。
报告称，在发现一名士兵存在操作困难时，“约翰·Ｓ·麦凯恩”号指挥官命令将当值团队分为两组，一组负责航行方向，另一组负责航行速度。分组对操作造成干扰，操舵团队被转移到其他控制台，而一些士兵未能认识到团队结构的调整。
报告还指出，负责驾驶“约翰·Ｓ·麦凯恩”号的指挥官和士兵“缺乏态势感知能力”，在与商船船头相交后也没有记录商船的航向和速度，导致船身被撞出一个直径28英尺（约合8.5米）的大窟窿。撞击发生时，落水的10名士兵都在住舱中。由于窟窿很大，住舱“几乎在撞击发生后不到一分钟内被水淹没”。
