台南市在本次6.7级强烈地震中灾情严重，目前伤患分送12间医院，台湾地区领导人马英九2月6日上午前往台南成功大学医学院附设医院(简称成大医院)探视伤患，允诺全力救灾。
据台湾“联合新闻网”2月6日报道，台南成大医院从6日清晨四点起不断涌入伤患，以擦挫伤等皮肉伤居多，多数包扎后离院。总铺师(总厨)李秋燕连夜赶年夜菜订单，地震时被热油泼伤脚，急救无大碍。据悉，院方召回200多名医护人力支援。
成大医院表示，截至上午10点30分收治62名伤患，以擦挫伤为主，目前7人住院，2人手术;另2人到院之前已经死亡，一名为10天大的女婴，另一位则为一名中年男子，女婴到院时无明显外伤，确切死因仍需厘清。
马英九表示，地震死亡失踪者目前有约80万元新台币的救助金，重伤25万元新台币，他强调，台军人力已到位，希望抢在黄金期救人。
