军方领导人仍然没有信服。曾于2008至2010年担任土耳其陆军司令的伊尔凯尔·巴什布最近在接受美国有线电视新闻网土耳其频道的采访时说，他曾警告过埃尔多安，提醒居伦在军队中的支持者所造成的威胁，当时军方已经停止了对有嫌疑的伊斯兰教徒的清洗。
他说他曾告诉埃尔多安：“今天这种威胁针对的是我们，明天针对的就是你。”
巴什布称，埃尔多安回答道：“我的司令，你说的太夸张了！”
巴什布退休后因为被控密谋推翻政府而被关进监狱。数百名与旧的世俗制度有关联的人士被警察和司法体系中所谓的居伦支持者当成目标，巴什布只是其中的一位。土耳其国家警察局前局长阿夫吉曾就居伦支持者所谓的威胁写过一本书，他也锒铛入狱。
埃尔多安最初对其中的一些调查行动表示支持，但是随着伪造证据以及其他不法行为被揭露，他最终否认自己与这些调查行动有关。
与此同时，这位土耳其领导人与居伦的联盟也开始瓦解，因为他试图取缔在警界和其他组织机构中所谓的“平行国家”。2013年12月，一些被认为忠于居伦的检察官发动了一场高调的腐败调查行动，让政府感到难堪，而埃尔多安后来则将这一行动描述为企图发动政变。
2014年，紧张局势进一步加剧，因为埃尔多安从总理变成了总统。在批评人士看来，埃尔多安此举是为了揽得更多权力。
最终，7月15日，军方部分人员发动了政变。他们占领了机场、桥梁以及军事基地，将陆军司令挟为人质，并控诉政府正在腐蚀民主和法治。敌对双方发生冲突，埃尔多安的支持者们走上街头支持他们的总统。一些抗议者死在了叛变士兵的枪口下，但是到了早晨已经明显可以看出这场政变已经失败了。总共有272人死亡。
埃尔多安很快便公开指责：他说发动这场政变的是居伦主义者。尽管居伦承认他的一些支持者可能参与了这场政变，但他仍然对这场政变表示谴责。
政变爆发第二天，居伦在其位于宾夕法尼亚州的大院中告诉记者：“就发动这场政变的动机而言，你能够想出很多种。这些人可能是反对党的支持者。这些人可能是民族主义政党的支持者。什么都有可能。”
不过他仍然对埃尔多安和他的政府提出了严厉批评。他说埃尔多安的政府“绝不容忍任何不在他们完全掌控之中的运动、团体以及组织。”
