岛内媒体人孙蓝23日对《环球时报》说，蔡英文一直没有正面承认“九二共识”，这在某种意义上可以看作破坏两岸和平稳定的政治基础，这么做只会使台湾未来的“国际发展空间”不复存在。蔡英文此次访问“双巴”看似风光，但其实对比前任的陈水扁和马英九，这次蔡英文只访问两个国家，其实是很寒酸窘迫的行程，蔡英文自称与美国交好，但在“过境”美国时只能“过境”迈阿密和洛杉矶，远离美国东岸的华盛顿、纽约等大城市，这些都是与之前有极大差距的待遇。
前“副总统”吕秀莲日前则在接受岛内媒体采访时表示，巴拿马是“邦交国”，蔡英文出访是顺理成章，不过就她了解的情况，目前巴方虽然广邀各国元首出席，但仅有十多个国家元首口头答应，书面答应的仅一位。吕秀莲因此提醒，对于蔡英文出访的意义，岛内民众“不要过度乐观”。
另据台湾东森新闻报道，目前巴拿马与巴拉圭两国均流行寨卡病毒及甲型流感，但由于时间问题，现在打甲型流感疫苗已经来不及，至于寨卡病毒，因缺乏有效的防范手段，台“外交部”只能提醒访问团成员穿长袖防蚊虫叮咬，不少随行记者调侃说，这是“赴灾区接受生死考验”。
不过，在所有面临的问题中，蔡英文当局最担心的就是“大陆因素”。台湾《联合报》23日评论称，台“国安”团队不仅担心大陆与巴拿马、巴拉圭建交，让“英翔项目”成为笑柄，也担心大陆会对美国施压给台方“穿小鞋”。甚至在蔡英文前往两国成功“固桩”后，大陆也有足够实力“拔桩”。因此，大陆“这个婆婆的脸色，台湾非看不可”。而随后召开的国际民航组织大会、亚太经合会经济领袖峰会，新政府少不得还是要看大陆的脸色。
台湾淡江大学教授陈一新分析说，2016年选举前，蔡英文数度讥笑马当局的“外交休兵”为“外交休克”，并嘲讽马当局的“外交”都要看大陆脸色。自己执政后，当家才知柴米贵，蔡英文现在知道大陆的脸色“虽不好看，但还非看不可”，她最需要担心的是，两岸没有“九二共识”政治基础，大陆“随时可以翻脸如翻书，且下手绝不手软”。
