马英九办公室12日晚发表声明指出，这次行程公开透明，高度自我约束，却仍被质疑有泄密之虞，不仅是对卸任领导人的不尊重，恐怕也会伤害台湾“自由民主的国际形象”。
在绿营这边，民进党“立委”王定宇则大赞：“总统府做了一个应该做的决定!”他表示，马英九是第一个在管制期间就要“出国”的“卸任总统”，罔顾曾经“身为国家元首的责任”。民进党发言人杨家俍的话则被台媒称之为对马英九的“补刀”，他表示，通过这次案例，台湾当局已建立“严谨可行”的“国家机密保护制度”，马英九日后若欲参与相关会议，“或可改以视频会议等为之，也可达到同样目的”。
国民党“立法院党团书记长”林德福说，民进党的操作有其考虑，让人感觉是用政治手段在处理。他同时表示，现在是民进党全面执政，不让马英九去，也无可奈何。
对蓝营的清算超过陈水扁时代
香港《东方日报》10日曾发表评论称，“马英九的香港行是对蔡英文总统风格及政治智慧的大考验。”张文生12日对《环球时报》说，这个消息其实让他感到有点意外，所谓民进党提出的不让马英九出境的理由都“不成其为理由”。张文生说，蔡英文上台后对蓝营的清算已经超过了陈水扁时代，就算陈水扁也没有搞所谓“转型正义”。“对马英九的清算才刚开了个头，未来将有更多蓝营人物遭到清算”。
今年5月19日，台北“地检署”宣布，马英九在任内因刑事豁免权而暂时签结、侦办中的案件有24件，于“5·20”政权交替当天依法重启侦办。岛内舆论普遍认为这是对马英九“政治追杀”的开始。
对于马英九未获准访问香港，前香港特别行政区政府首席顾问刘兆佳表示“不感意外”，12日他对台湾“中央社”记者说，马英九此时访港“会加大蔡总统的压力”。他说，虽然马英九已经卸任，但他的两岸政策获得多方肯定，马在蔡刚上任“总统”后就到香港这个国际大都会讲两岸政策，也就是肯定他自己在两岸关系上的成就，这难免会凸显蔡英文政府在两岸政策上的不足。刘兆佳说，香港绝对没有安全风险问题，不会有人想“谋杀马英九”。
张文生对《环球时报》说，蔡英文此举只会造成岛内政党斗争恶化，蓝绿对峙更加厉害，而类似清算行动会造成蓝营政治人物人人自危，不免会打击到岛内愿意发展两岸关系、承认“九二共识”的人士，甚至造成寒蝉效应，逼得台湾一批统派人士移民大陆或海外。
