在2000年时，由于印尼的暴行日趋恶化，东帝汶人民的不断抗争与联合国的介入，令东帝汶的独立终于再次成为可能。而废除印尼与澳大利亚签订的关于东帝汶的“不平等条约”，与澳大利亚重新划定海洋边界的事情，也成为了东帝汶必须处理的头等大事。
但澳大利亚人并不愿意与东帝汶重新划界，甚至希望东帝汶可以直接继承之前的“不平等条约”，在共同开发的区域与澳洲人50-50分成。根据2003年《经济学人》杂志等媒体的报道，当时澳大利亚官方为了达到目的，采取了非常强硬、甚至野蛮的态度，对东帝汶的新政府进行了一系列的恐吓，比如威胁取消人道主义援助，甚至澳方还一度打算阻止联合国介入两国的谈判...
最终，当联合国负责东帝汶事务的代表Peter Galbraith对澳洲方面的态度忍无可忍，准备要把澳洲告上国际法庭时，澳洲人这才于2002年时做出“巨大让步”，同意把之前与印尼定下的那个50-50分成的“共同开发区”中90%的矿产税收益都给东帝汶，自己只拿10%。
但同时，澳洲人也“狡猾”地在这一年退出了《联合国海洋法公约》以及国际法庭一切关于海洋划界的强制仲裁程序。如此一来，东帝汶即便将来想明白了这“慷慨”的条约中的“坑”，也拿澳洲没辙。
而此时才刚刚独立，并处在一片废墟中的东帝汶，因为急需钱进行重建工作，缺乏有力的谈判资本，也只好搁置海洋划界的争议，与澳洲人签订了这份《帝汶海合约》。
不过，虽然乍一看澳大利亚似乎在2002年与东帝汶签署的这个《帝汶海条约》中吃了大亏，但实则不然。实际上，澳大利亚利用刚刚独立的东帝汶非常缺钱，国家一穷二白，缺乏谈判资本的困境，仍然设置了大量不平等的内容。
