但随即，朱镕基就对房地产过热感到担忧。
在2011年出版的《朱镕基讲话实录》第四卷中，刊登了2000年底他在中央经济工作会议上的讲话，他讲到：“房地产业里面的弊端大得不得了，里面的门道可多了……现在房地产有点热，不敢说过热，不能再这么干下去了”。
这主要源于地产空置率高及贷款风险大。2002年国庆节，朱镕基视察深圳，针对房地产热他表示：“有些城市，不是全部，房地产有一点热，空置率太高，而且还在增长。”
朱镕基解释道，内地百分之二十至三十的房地产公司，二、三成的资金来源是向银行贷款，而百分之三十以上的购买用户也是向银行贷款，房地产本身百分之六十以上是靠银行贷款，风险很大。但是目前具自付能力的市民占少数，很大一部分是高级房地产，而且价涨得很快，这一部分不属于广大市场的购买力可以适应，靠台湾、香港和外国投资者来买房子，价格越推越高，房子越盖越多。
2003年1月，朱镕基召开国务院第九次全体会议，这也是其任期内的最后一次全体会议。那次会议讲话，也被媒体视为是朱镕基的卸任总结。据《朱镕基讲话实录》第四卷中《值得纪念的五年》一文显示，在这次全会上，朱镕基对房地产过热表达了担忧。
“中国的泡沫经济已经形成，房地产过热，风险太大。我们银行的同志一定要意识到这一点，因为这些钱都是银行的。我再一次向银行的同志忠告：你们也许这两年就升官了，你们也许就不会再干银行工作了，以为出了问题可以让后来人收拾。”
朱镕基退休后
“房地产(问题)根子就是房改政策错误”
卸任后，朱镕基以出书或演讲等形式，几次对中国房地产发表看法。
2011年4月，清华大学建校100周年纪念日时，朱镕基作为清华大学校友回到母校。在清华大学学术报告厅，朱镕基与清华学子交流了农业发展、房地产改革、教育制度等多个方面。
据媒体报道，在这次交流中，朱镕基还重点谈论了房地产问题。
朱镕基说：“最近呢，还有一种谬论呢，国外的报纸也有，国内的报纸也有，说这个房地产项目这么沉重，都是过去这个分税制搞坏了，说税收都收给中央来了，地方没钱了，所以它只有发展房地产才有钱?狗屁!”座谈现场爆发大笑。
对此，朱镕基反驳到：“(财政收入)总共8万亿，一来一回(地方)收回来7万3千亿，还少啊?还没钱?现在地方有的是钱。这房地产(问题)根子就是房改政策错误。”
朱镕基说：“我们制定了一个错误的政策，就是房地产的钱，都收给地方政府，而且不纳入预算，这不得了。这个钱就是搜刮民膏，所以把地价抬得那么高。这个绝对不是分税制的错误。地方没少收钱。”
“政事儿”(微信ID：gcxxjgzh)撰稿：新京报记者 郑书 实习生 何强 校对：郭利琴
